唇腭裂的預防關鍵在于懷孕早期，即妊娠頭3個月左右是關鍵時期。孕婦要避免煙酒、病毒感染、污染等可能的致病因素，適當補充葉酸。還需要提醒的是，有的愛美女性會使用一些減肥、豐胸產品，長時間服用，這其中所含的激素也可能帶來不良后果。
預防唇腭裂 孕早期是關鍵
具體說來，目前得到公認的唇腭裂可能致病因素大概有以下幾點：
遺傳因素：在過往被臨床診療患者中，只有少數的患者可查到家族性因素，為多基因遺傳性疾病，再發的危險性相對較小。
若父母正常且第一位子女唇腭裂，生育第二位唇腭裂子女可能性為5%。若父母中有一位唇腭裂患者，生育唇腭裂子女的可能性為5%。若父母都是唇腭裂，生育第一位子女的可能性為25%。
環境因素：尤其在城市里，水、空氣的污染對懷孕的女性來說都十分危險，還有病毒感染（如流感）、X射線、汽車尾氣、微波等，都可造成遺傳基因的突變等。
藥物因素：母體懷孕期間患有如貧血、糠尿病、嚴重營養障礙等慢性疾病或服用某些藥物，如鎮靜藥、抗癲癇藥及激素類藥等。
