米非司酮膠囊服藥后，一般會較早出現少量陰道出血，平均9～16天，部分婦女流產后出血時間較長，8%可達30天或更長，曾有出血達69天的報告。米非司酮為受體水平抗孕激素藥，具有終止早孕，抗著床，誘導月經及促進宮頸成熟等作用，與孕酮競爭受體而達到拮抗孕酮的作用，與糖皮質激素受體亦有一定結合力。米非司酮能明顯增高妊娠子宮對前列腺素的敏感性。小劑量米非司酮序貫合并前列腺素類藥物，可得到滿意的終止早孕效果。 米非司酮膠囊緊急避孕藥的不良反應有以下幾點：子宮出血和下腹痛(包括子宮痙攣)是用本品治療可預見的結果，部分婦女出血量超過最大月經量；部分早孕婦女服藥后，有輕度惡心、嘔吐、頭暈、頭痛、疲勞、腹瀉，肛門墜脹感；個別婦女可出現皮疹。其它不良反應有：背痛、發熱、陰道炎、寒戰、消化不良、失眠、腿痛、焦慮、白帶和盆骨痛；使用前列腺素后可有腹痛，部分對象可發生嘔吐腹瀉；少數有潮紅和發麻現象。實驗室檢查可有血色素，血球壓積和血紅細胞下降，極少數可有血清ALT、AST、ALP及γ-GT增高。