女性服用避孕藥會導致惡心、嘔吐、月經紊亂等副作用，而相比較之下男性避孕藥這方面顯著優勝很多。

男性避孕藥避孕有效率高達99%，而且對服食者帶來較少不良副作用。英國蘇格蘭愛丁堡大學人類繁殖研究員安德森表示，在連串測試的結果發現，男性避孕藥不會像女性避孕藥那樣存著多種副作用，女性避孕藥的副作用包括影響情緒波動、凝結血塊、頭暈、作嘔和頭痛。男性避孕藥的副作用應當很少，只會導致服食者的體重略為增加。

有專家指出，男性避孕藥的另一個好處是，男性避孕藥不會像切除輸精管那樣難以還原，因為男士只要停服避孕藥十六周便可恢復生殖能力。