顧名思義，轉基因大豆油是從轉基因大豆里面提取的油脂，而非轉基因大豆油是從常規種植大豆里面提取的油脂。轉基因大豆最顯著的一個特點就是可以抵抗殺草劑——草甘膦。草甘膦會把普通大豆植株和雜草一起殺死，但是卻不能殺死轉基因大豆植株。非轉基因大豆是通過自然界的優勝略汰選擇基因的變化而存在下來的。

世界上最好的非轉基因大豆產地在中國東北 ，價格很多，而又在美國人手里買回轉基因大豆。因為它的價格便宜，出油量多，能滿足中國人的用油需求。

總的來說，用這兩種不同大豆榨出的油，它們的成分幾乎沒有差異，而味道并非專業人士也分辨不出來的。